公司向公司登记机构提交法人变更申请后，如果法人代表变更决议无效的，可以申请撤消变更登记。《中华人民共和国公司登记管理条例》第四十条公司依照《公司法》第二十二条规定向公司登记机关申请撤销变更登记的，应当提交下列文件：
（一）公司法定代表人签署的申请书；
（二）人民法院的裁判文书。《中华人民共和国公司法》第二十二条【公司决议的无效或被撤销】公司股东会或者股东大会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。股东会或者股东大会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东可以自决议作出之日起六十日内，请求人民法院撤销。股东依照前款规定提起诉讼的，人民法院可以应公司的请求，要求股东提供相应担保。公司根据股东会或者股东大会、董事会决议已办理变更登记的，人民法院宣告该决议无效或者撤销该决议后，公司应当向公司登记机关申请撤销变更登记。
二、公司法定代表人变更程序
（一）召开股东会决议或董事会决议，并做出产生或变更公司法定代表人决议。
（二）办理变更公司法定代表人登记手续：
1、领取《公司变更登记申请表》(工商局领取)；
2、变更营业执照(填写公司变更表格，加盖公章，整理章程修正案、股东会决议、承诺书、公司营业执照正副本原件、到工商局办证大厅办理；
如果存在股权转让须填写股权转让协议，如果法人是外地户口那么要办理暂住证)；
3、变更组织机构代码证(填写企业代码证变更表格，加盖公章，整理公司变更通知书、营业执照副本复印件、企业新法人身份证复印件、老的代码证原件到质量技术监督局办理)；
4、变更税务登记证(税务局办理)；
5、变更银行信息(基本户开户银行办理)。
通过上述分析知道，依据《公司登记管理条例》的规定，公司作出变更法人代表的决议，办理法人代表变更登记后，如果变更法人代表的决议无效的，可以申请撤销法人代表变更登记。
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