对一切违法所得会进行追缴，所以用犯罪所得出资的，会将出资所得的股权拍卖或者变更，对所得价款进行收缴，追缴后一般上缴国库。《中华人民共和国刑法》第六十四条【犯罪物品的处理】犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；
对被害人的合法财产，应当及时返还；
违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
二、洗钱罪与掩饰隐瞒所得收益罪的界限
刑法第312条规定的掩饰、隐瞒犯罪所得、犯罪所得收益罪，与洗钱罪，两者都属于连累犯的范畴，即行为人明知是犯罪分子的违法所得，仍事后给予了犯罪分子某种帮助，因此，两者存在着很大的联系。
但是，从具体犯罪构成要件而言，两者也存在着以下几方面的区别：
1、侵犯的客体不同，前者侵犯的是双重客体，其中主要客体是金融管理秩序，从而该罪被归类在”破坏社会主义市场经济秩序罪”，后者侵犯的是单一客体，即社会管理秩序。
2、行为的对象不同，前者特指毒品犯罪、黑社会性质的组织犯罪、走私犯罪的违法所得及其产生的收益，后者泛指一切犯罪的所得赃物。
3、行为方式不同，前者是指通过某类中介机构来隐瞒和掩饰违法所得及其收益的性质和来源，后者则包括窝藏、转移、收购或代为销售赃物四种行为。
通过上述分析知道，依据《刑法》的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。
所以犯罪所得用于出资的，办案机关会将股权拍卖或者变卖，对所得价款进行追缴。
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