房屋物权的设立以登记为准，所以宅基地房屋的所有权认定，要看有没有登记，如果没有登记的，可以通过申请确权的方式确定所有权。《中华人民共和国民法典》第二百零九条【不动产物权登记的效力】不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；
未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。第二百三十三条【物权纠纷解决方式】物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。第二百三十四条【物权确认请求权】因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。
二、农村宅基地房产证怎么办
理农村房屋产权证办理流程如下：
首先申请人提交下列材料提出申请，提交农村房产证办理需要提交的材料后，工作人员会受理，经过公告、审核，缴纳相关费用后即可记载于登记簿，取得产权证。
农村房屋宅基地房产证办理的流程非常简单，一般情况下按照工作人员的指示办理即可。
根据《不动产登记暂行条例实施细则》的规定，因合法建造房屋申请房屋所有权初始登记的，应当提交下列材料：
（一）登记申请书；
（二）申请人的身份证明；
（三）宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
（四）申请登记房屋符合城乡规划的证明；
（五）房屋测绘报告或者村民住房平面图；
（六）其他必要材料。
申请村民住房所有权初始登记的，还应当提交申请人属于房屋所在地农村集体经济组织成员的证明。
通过上述分析知道，依据《民法典》的规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；
未经登记，不发生效力。
所以宅基地房屋所有权确认，要看是否有登记，登记在谁名下的，谁就享有所有权。
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