公司法人代表死亡后，由法人代表的继承人继承股权，继承人持死亡证明，身份证、出资证明等材料到公司登记办理股权变更登记。《中华人民共和国公司法》第七十五条【股东资格的继承】自然人股东死亡后，其合法继承人可以继承股东资格；
但是，公司章程另有规定的除外。《中华人民共和国公司登记管理条例》第三十四条有限责任公司变更股东的，应当自变更之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。有限责任公司的自然人股东死亡后，其合法继承人继承股东资格的，公司应当依照前款规定申请变更登记。有限责任公司的股东或者股份有限公司的发起人改变姓名或者名称的，应当自改变姓名或者名称之日起30日内申请变更登记。
二、公司股权变更流程是怎样的
1、公司去工商部门领取公司变更申请书的有关表格(包括股东会决议和章程修正案)，根据他们的要求进行手填或打印有关文件并加盖公章或股东签字。
2、写好股东的退股支出单及记账凭证，如果是转股，还要写好股东的入股收款单及记账凭证.如果是老股东，就不用进行验资了；
如果是转让给新的股东，还需要将这部分投入资本进行验资。
3、到会计师事务所领取“银行询征函”：
4、去银行存入投资款：
股东带上自己入股的那一部分钱到银行，法人代表的私章、身份证、用于验资的钱、空白询征函表格，按自己出资额向公司帐户中存入相应的钱。
5、带上所有表格去会计师事务所出具验资报告。
6、所有资料提交工商部门，三日后换取新的营业执照。
依据《公司法》的规定，法定代表人为公司股东死亡后，其合法继承人可以继承股东资格。
继承有继承其资格后，可以到公司登记机关办理股东和股权变更登记，在股东名册中删除法定代表人名称，加上继承人名称。
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