1、农村宅基地纠纷诉讼时效一般是3年，从当事人知道权利被侵害时开始计算。如果是请求停止侵权行为或者返还宅基地等诉讼的，不受诉讼时效限制。
2、法律规定：
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。第一百九十六条【不适用诉讼时效的情形】下列请求权不适用诉讼时效的规定：
（一）请求停止侵害、排除妨碍、消除危险；
（二）不动产物权和登记的动产物权的权利人请求返还财产；
（三）请求支付抚养费、赡养费或者扶养费；
（四）依法不适用诉讼时效的其他请求权。
二、宅基地纠纷调解程序是怎样的
1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请；
2、双方当事人出示举证的材料和依据；
3、工作人员现场调查材料和取证；
4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书；
5、调解为达成协议的，或者调解书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府处理决定。
在面对宅基地拆迁补偿纠纷的时候，先进行调解，不能调解成功再进行起诉。
依据《民法典》的规定，宅基地产生纠纷的，向法院主张权利的时效是3年，但如果是请求停止侵害、排除妨碍；
请求返还宅基地等的诉讼，案件不受诉讼时效的限制。
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