可以向法院起诉。实际中，小产权房被拆迁会根据以下情况确定是否能够补偿：
1、在集体建设用地上建成的房子，并依法办理了审批手续，属于合法建筑，被拆迁有补偿。但是，因为购买小产权房后不能拥有所有权，所以，拆迁补偿款归于有所有权的集体内部。不过，如果买家跟卖家在买卖合同中约定了，若被拆迁全部补偿归于买家，那么卖家拒绝支付补偿的，买家可以向法院起诉处理。并且，向法院起诉时要按照以下步骤进行：
(1)写份起诉状，写明要求对方积极履行合同，支付房子的补偿金，以及其他违约损失。
(2)去法院起诉，除了提交起诉状外，还要提供相应的证据，比如买卖合同。
(3)准时参加诉讼，按规定，向法院提起诉讼后，请求人无正当理由拒绝出庭的，可能会被撤诉处理。
2、在集体企业用地或者占用耕地违法建成的房子，属于违章建筑，被拆迁无补偿。不过，购买小产权房的人对此无过错的，比如被卖家欺诈买到小产权房，那么照样可以主张对方赔偿损失。《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条规定，房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。
二、小产权房的拆迁补偿会比大产权房低吗
进行拆迁的时候，如果小产权房是属于合法建筑的，获得的拆迁补偿不会比有证房屋低，如果是违法建筑的，甚至没有拆迁补偿。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十一条被征收人可以选择货币补偿，也可以选择房屋产权调换。
被征收人选择房屋产权调换的，市、县级人民政府应当提供用于产权调换的房屋，并与被征收人计算、结清被征收房屋价值与用于产权调换房屋价值的差价。
因旧城区改建征收个人住宅，被征收人选择在改建地段进行房屋产权调换的，作出房屋征收决定的市、县级人民政府应当提供改建地段或者就近地段的房屋。
第二十四条市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。
市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。
对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；
对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。
我们可以了解到购买小产权房后又遭到拆迁的，虽然小产权房的价格较低，并且双方的买卖合同会归于无效，但是，双方做了明确的约定的，就要按约定交付补偿款。
不过，如果还有其他特殊情况，那么建议可以在必要时找个专业律师介入。
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