土地被划定为基本农田保护区后，养殖场因此而搬迁，致使畜禽养殖者遭受经济损失的，由县级以上地方人民政府依法予以补偿。《畜禽规模养殖污染防治条例》第二十五条因畜牧业发展规划、土地利用总体规划、城乡规划调整以及划定禁止养殖区域，或者因对污染严重的畜禽养殖密集区域进行综合整治，确需关闭或者搬迁现有畜禽养殖场所，致使畜禽养殖者遭受经济损失的，由县级以上地方人民政府依法予以补偿。
二、养殖场拆迁补偿项目有哪些
养殖场(鱼塘、养猪、羊、牛等)的征收补偿包括四方面：
对地的补偿；
对地上附着物的补偿；
停产停业的补偿；
合理的拆迁费用。
1、土地的补偿，土地是自己的承包地，土地确权明确，土地可以获得补偿，如果是租用的土地，土地补偿归实际承包权人所有；
2、养殖场建筑物、附属物的补偿，根据养殖场实际建筑面积、建筑结构以及附属设施综合评估计算补偿金额；
3、停产停业损失的补偿，有合法的养殖手续和营业执照，根据实际产值情况可以获得停产停业损失的补偿；
第四，设备折旧及搬迁的补偿，养殖场内的设施设备评估后折旧的补偿，养殖场剩余物料搬迁时产生的搬迁费等都可以获得补偿。
第五，禽畜出清补偿，这一项补偿一般是按照存栏禽畜的大小和种类进行补偿。
土地被国家划定为基本农田后，对基本农田内的养殖场进行搬迁的，要给予养殖场相应经济补偿，而怎样给予经济补偿，由县级以上地方人民政府依据相关法律规定执行。
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