如果是农村房屋产权问题首先肯定是需要由当事人进行协商处理。其次如果双方之间协商不下的话，那么就由当地政府来对土地的相关所有权进行处理。如果当地政府不能擅自处理的话，那么当事人其中一方可以向法院提起相关诉讼。
1、首先是协商解决
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。公民之间发生的农村房屋所有权纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
2、其次是行政解决
个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。“侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
3、再次是司法解决
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。否则，人民法院不予受理。但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民法院起诉。
4、最后，农村房屋所有权纠纷还可以通过人民调解来解决。
人民调解是指在调解委员会(包括城市的居民委员会和农村的村民委员会)的主持下，以国家的法律、法规规章、政策和社会公德为依据，对民间纠纷当事人进行说服教育、规劝疏导，促进纠纷当事人互相谅解，平等协商，从而自愿达成协议，消除纷争的一种群众自治活动。
从协商解决到行政解决到司法解决再到最后的人民调解解决，公权力与人民协商的结合程度在不断加大，给予了当事人最好的解决纠纷的权利。对于农村房屋产权问题其实最主要的问题还是在当事人双方之间。如果当事人能够进行协商处理的话，那么是最快也是最好的解决办法。如果双方协商不下的话，并且当地政府调解不下的话，最好的方式就是提起法律诉讼，由法院来进行调查和取证来确定谁最后拥有房屋产权。
其实房屋产权纠纷就是双方当事人之间的民事纠纷，民事纠纷的处理方法其实可以总结为四种，分别是协商、调解、诉讼以及仲裁，但是具体选择何种的方式来处理双方当事人之间的纠纷是不确定的，由发生纠纷的双方当事人之间自由选择。
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