夫妻不合长年分居，不管多长时间都不算自动离婚。想要离婚有两种方式，协议离婚和离婚诉讼。双方都同意离婚才能进行协议离婚。诉讼离婚时，夫妻因感情不和而分居满两年的，法院会认定为夫妻感情破裂，调解无效后，会判决准予离婚。
法律依据：
《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
夫妻常年分居不可自动离婚，离婚必须按照法律程序进行。我国不存在自动离婚的说法，即使夫妻分居多年，符合分居离婚的条件，也不能就此自动解除婚姻关系。而是需要通过协议或者诉讼方式来达到离婚目的。
根据《民法典》第一千零七十九条第三款第（四）项以及第五款的规定，因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
法律依据：
《民法典》第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
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