婚姻关系不会自动解除。因感情不和分居满两年只是准许离婚的一个条件，只要能够证明因感情不和分居满两年的，法院就应当判决离婚。离婚只有两个途径：
一、协议离婚：如果双方都同意离婚，并且对夫妻共同财产的分割及子女抚养问题达成一致意见的，可以由婚姻登记机关发给离婚证。
二、如果双方在离婚、夫妻共同财产分割、子女抚养三个问题中有一个问题不能达成一致意见的，则需由法院判决能否离婚。
《民法典》第一千零七十九条【诉讼离婚】夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
(一)重婚或者与他人同居;
(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员;
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改;
(四)因感情不和分居满二年;
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
《民法典》第一千零七十九条、第一千零七十六条、第一千零七十八条
二、协议离婚手续办理流程
协议离婚手续办理流程如下：1、申请。协议离婚必须双方亲自到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请，不得委托他人代理。申请时各方应持户口证明、居民身份证明、所在单位或村、居民委员会出具的介绍信、离婚协议书、结婚证等，以便登记管理机关查明当事人身份，确定管辖权。2、审查。婚姻登记管理机关在受理当事人的离婚登记申请后，应当在一个月内进行审查，在审查过程中，应全面了解协议的内容，尤其是注意双方当事人请求离婚的意思表示是否真实，子女抚养夫妻一方的生活困难帮助、分割财产及债务处理等事项是否合适。3、登记。婚姻登记管理机关审查后，对符合离婚条件的，应予登记，发给离婚证，注销结婚证；对于不符合法定条件不予登记的，应以书面形式说明不予登记的理由，夫妻关系从当事人领取离婚证时起解除。离婚的当事人一方不按照离婚协议履行应尽义务的，另一方可以向人民法院提起民事诉讼。4、撤销。申请离婚的当事人弄虚作假、骗取离婚登记的，婚姻登记管理机关应当撤销离婚登记，对离婚的当事人宣布其解除婚姻关系无效并收回离婚证，并对当事人处以200元以下的罚款。如果当事人认为其符合离婚条件，可以依法申请行政复议，对复议决定不服，可以依法提起行政诉讼。婚姻关系当事人双方对财产分割、子女抚养问题协商不成，或者一方要求离婚，而另一方不同意离婚的情况下，应通过诉讼的方式来达到离婚的目的。
《婚姻登记条例》第十条、第十一条
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